1、建筑墙体的装修
医药洁净厂房的设计墙体要求无毛糙、平整、光滑等，因此，在洁净厂房墙体装修时，一般会选择新型的材料进行装修，同时，要考虑到墙体与墙体之间，墙体与地面之间，墙体与顶棚之间不能存在直角，需要做圆弧状，方便后期的清洁。在此之外，墙体的色彩选择通常会使用天蓝、白色等干净的色系，不但有利于后期墙面清洁，同时能够达到舒缓工作压力的效果。在对建筑物内部隔断时，一般会采用彩钢板等轻质材料，为了真正能达到防火的要求，彩钢板的内部填充物应该选择难燃或者不燃材料，而不能使用具有污染或者是有机材料。除此之外，还要对彩钢板的厚度和强度进行筛选，这是保证墙面强度的重要方式。
2、建筑顶棚的装修
对于医药洁净厂房顶棚装修，要综合考虑顶棚装修材料的耐用性、变形小、光滑性、气密性、易清洁消毒等。一旦在生产过程当中发现顶棚材料出现问题，比如坍塌、脱落等情况，这会对医药产品的生产带来很大的威胁，针对当前医药洁净厂房的设计要求，按照严格的方式进行筛选，综合考虑到强度好，防火性能好，表面光滑等内容。顶棚和墙壁要选择同等材料，不仅有利于墙体和顶棚结合的密闭性，同时保证成品连接结构能够使墙体和顶棚更加紧密，保证质量的同时更显美观。彩钢板具有使用寿命长、施工便捷等优势，在节约企业装修成本的前提下，要保证持续的生产需求和要求。在顶棚装修过程当中，也要考虑到暖通专业（送回风、新风、排风、排烟空调等管道）、电照（包括电缆、桥架、检修照明、应急照明灯）及给排水（消防喷淋、给水及排水管）等的安装要求。医药洁净室吊顶空间一般高度要求比较高，因此需考虑吊顶材质及龙骨的刚度要求，同时考虑吊顶空间各管线的复杂程度及后期的检修，条件允许的情况下一般需要设置检修走道或检修马道。
对于顶棚的骨架所采用的材料一般是烤漆、铝型材等，顶棚所使用的面层材料一定要求不积尘、不积灰，一般选用材料为金属板材，对于洁净度要求较低的房间，也可以直接使用抹灰油漆顶棚。
3、建筑地面的装修
医药洁净室地面的装修，一般需考虑整体性好、平整、耐磨、防潮及不易积灰、好清理的地面材料，同时结合生产的特点及不同生产工艺的要求，选取配套适应性的材料。甲、乙类生产车间或仓库的地面需同时考虑不发火花及防静电的要求。建筑及地面衔接部分也需考虑弧形收边的问题，以便清洁不藏灰。为保证地面强度防止开裂，可采用配筋混凝土及掺钢纤维混凝土。地面垫层需考虑设置防潮层，防止地下水对地面的影响，产生空鼓、返潮等问题，影响生产设备及药品生产、存放等。
4、建筑门窗
医药洁净室一般不宜设置外窗，但为了满足规范或造型要求等必须设置外窗时，需采用断热型材中空玻璃固定窗，或在内侧洁净墙板处另设单层密闭窗。洁净室内侧隔墙一般会根据功能或者业主需求设置观察窗，观察窗一般与内隔墙齐平，并不宜设置窗台。
医药洁净室门设置一般依据设备搬运安装、检修及消防疏散的要求。洁净室门一般需要设置双层玻璃观察窗，并与门扇齐平，门设闭门器，确保不同洁净级别的房间之间的气密性的要求。门的开启方向一般为向洁净度高的或者压力高的房间开启，但若门的开启方向与消防规定冲突的话，需以消防规定为前置条件。
总之，医药洁净室的内装修材料应当平整、光滑、易清洁并避免积尘，根据生产产品及生产工艺需求选择合适的装修材料，满足GMP的要求。同时也需满足国家规范《建筑内部装修设计防火规范》GB50222-2017规定的要求。