特色小镇的类型有很多，其中旅游特色小镇表现抢眼，取得了不错的成绩，成为了旅游开发的热点。但是，随着旅游特色小镇的建设，一些问题逐渐表现出来。
1、旅游特色小镇的概念不清
旅游特色小镇的理解目前存在着一些误区，主要表现在以下几个方面：
1）将旅游特色小镇的“小镇”和行政区划上的小镇划等号，但事实上一个建制镇面积很大，几十平方公里很常见，但特色小镇的规划面积一般在3平方公里左右，建筑面积应控制在1平方公里左右，旅游特色小镇是具有明确文化、旅游、产业和社区功能的重要功能平台。
2）将旅游特色小镇理解为新景区开发。旅游特色小镇不仅要注重“景观”，更要注重的是核心竞争力的特色“产业”。
3）美丽乡村、田园综合体、旅游特色小镇这三者在本质上的差别很大，不可混淆，其创建也不能应用同一模式。
2、特而不特，“特色”一词无从谈起
总体来看，我国旅游特色小镇的开发还属于初级阶段，为游客提供的旅游休闲产品过于单一，同质化问题较为严重。部分旅游特色小镇不注重挖掘自身拥有的文化内涵，不顾旅游特色小镇运作的基本规律，造成特色产业和小镇功能脱离实际，无法将小镇的开发建设和当地的文化结合，难以有效利用当地独特的生态环境及人文环境，为了短期利益开发了一些没有文化内涵的产品，无法为当地经济增长增加新动能，缺乏对游客的持续吸引力。
3、主体不清
特色小镇的发展，市场才是主体，不能采用老旧的发展思路，盲目追求短期政绩。
4、房地产渗透
旅游特色小镇不是房地产小镇，当前如碧桂园、绿城等一线房地产企业都推出了“小镇计划”，虽然这有助于通过房地产企业的资本，助推旅游特色小镇的发展，但很容易导致旅游特色小镇成为房地产公司圈地的一项借口，这个需要引起足够重视。
5、缺乏联动
从目前旅游特色小镇的建设进程来看，很多旅游特色小镇策划基本都是以旅游产业作为主导产业展开的，很多旅游特色小镇往往将旅游产业定位于较高的层次，使得旅游特色小镇自身的产业结构单一，没有形成以“旅游+”、“+旅游”为模式的创新业态，缺乏联动的产业机制，容易受到资本、季节等因素的冲击。
6、产业生存环境还有很大的提升空间
我国旅游小镇的旅游产业，在发展过程中还存在着行业准则不完善、市场机制不健全、功能配套不到位、旅游产业发展和当地居民利益冲突等较多问题，产业生存环境依然面临着较大考验。许多旅游小镇本身的经济基础薄弱，产业结构层次低，对旅游业的投入和发展能力不足，不能满足旅游小镇的开发需要，因此资金缺乏已成为制约旅游小镇开发建设及发展的主要因素之一。