洁净厂房的建筑设计是一项综合性很强的内容，建筑在进行设计的过程当中，要考虑到生产与生活之间的关系，合理规划室内外的建设，并积极寻求两者之间的平衡，保证空间功能使用的合理、美观、经济性的综合效果。洁净厂房设计更加侧重于净化的各种技术分类以及工程应用的统筹安排，从而获得最优质的综合效应使用空间，尤其是关于洁净室的设计及空气净化的设计。下面建筑规划设计研究中心浅谈一下医药洁净厂房的设计要求：
1、选址
对于医药洁净厂房的设计直接与人体健康程度有着紧密的联系，因此在进行建设的过程当中，需要对厂房设计的力度加大。在选择医药厂房的过程当中始终坚持GMP要求，同时，从多个角度来综合考量厂房的空气洁净程度问题。首先，要选择通风性较强的地带，从而减少粉尘对我们的伤害，大大降低空气过滤工作所花费的成本，大大提升空气过滤系统的运行效率；其次，不能简单地将医药洁净厂房的场地选择在靠近居民区或者污染程度较为严重的地带，由于污染较为严重的工程对医药的品质会有很大的妨碍。因此，在实际的生产和运营过程当中，也会产生大量的废气废水，这些有害物质会对洁净厂房的工作产生很大的影响。最后，在进行厂房选址时，需要对该建筑地点的周边环境进行深入的考察，并观察排污、水电、交通等方面的影响问题，通过选择适合医药洁净厂房长期使用的地点，并对建设设施进行全面的设计和优化。
2、保证洁净度的设计要求
在进行厂房平面布置时，要综合考虑多方面的因素，尤其是建筑的间距、建筑使用性能、天气，气候以及风向等因素。在对建筑物的间距选择时，要保证洁净厂房与交通干道距离在50米以上，由此，防止噪音或者路面对生产厂房之间的影响。在对厂房功能区域的设计需要综合考虑到风向的问题，尽量将生产工艺的下游建筑安排在下风向，对于生产洁净度要求较高的厂房，安排在上风向，这是保证药品生产质量的重要方式。