1、优势
1）区位和交通优势
生态产业园位于我国三大经济区域之一的珠三角地区的的核心区。紧邻东莞市中心城区，是东莞“四位一体”城区框架的重要组成部分；毗邻港澳，距离广州、深圳和香港机场均在1.5小时车程内。东部快速路横跨全境，与广深铁路、珠三角区域城际轨道和东莞城市轨道系统交织成网，距离石龙东莞新客站仅10分钟车程，这将有利于先进制造业和现代服务业的集聚与发展。
2）产业环境优势
东莞已经发展成为世界著名的电子信息产业制造业基地，产业配套十分完善，这为生态产业园产业发展向上下游延伸提供了良好的基础和条件。生态产业园位于东莞三大产业带中的园区产业带，与松山湖、长安滨海新区一起作为引领东莞产业未来，带动产业调整升级的重要战略性区域，这将有利于生态产业园确立东莞产业高地的竞争优势。
3）政策优势
在政策上，东莞生态产业园已经成功获批省级循环经济试点园区，将获得部分省级政策优惠。东莞市高端重视生态产业园的建设，也将在土地、项目审批、投资资金等方面给予一定倾斜。
2、劣势
1）土地资源相对短缺，生态修复成本较高
在开发成本上，生态产业园的土地是周边6镇的交界地和排污地，环境污染十分严重，在产业开发的同时必须先进行生态修复，修复成本较高。
2）统筹整合周边资源时间成本较高
在产业培育上，生态产业园所处区域属于东莞市欠发达地区，所统筹的范围内没有一个成型的产业集聚区，产业基础薄弱，产业层次较低，对高端产业的配套服务能力较弱。
3）统一管理难度较大，经验缺乏
发展生态产业园区的经验缺乏、环境不完善。经过多年的发展，东莞在招商引资、承接国际产业转移方面积累了丰富经验，但在发展生态型产业和建设生态型园区方面的缺乏经验。吸引人才和承接生态型产业转移的软硬件环境不完善。生态产业园经营管理模式还处于比较初级的阶段，很多管理架构还没有完全建立起来或者还没有完善，与市和各镇之间的利益关系尚没有完全理顺，影响了园区的建设进程。
3、机遇
1）国际环境机遇
从国际看，全球金融危机已经过去，世界经济逐步企稳回升。在金融危机的冲击下，国际经济格局发生重大变化，世界新科技革命和产业革命正在孕育新的重大突破，生物、新能源、新材料等一批新兴产业正在快速兴起。兰德公司的报告指出：生物技术、纳米技术、信息技术的融合和突破有可能引发新的产业革命，为后发国家和地区实现跨越发展提供了难得的历史机遇。随着全球分工的不断细化，世界500强等知名企业纷纷加大对发展中国家，特别是我国的投资，这将有利生态产业园引进国际先进企业，切入全球价值链高端环节。
2）国内环境机遇
从国内看，国家正加大对低碳经济和战略性新兴产业的扶持力度，转变经济发展方式成为全国经济发展的主线。生态产业园的建设理念和产业导向符合国家的产业发展方向，有可能争取到国家级的重点生态产业项目布点。
3）省内发展机遇
从省内看，在《广东省新型城镇化规划（2014-2020年）》、《珠江三角洲全域规划（2014-2020年）》的指引下，珠三角一体化进程加速推进，这将有利于处于珠三角核心区的生态产业园进一步拓展产业空间，密切与香港、广州、深圳等中心城市的产业联系。
4）东莞市内机遇
从市内看，东莞市提出经济社会“双转型”战略，提出要建设国际制造名城和生态型城市，产业导向将发生新的变化，产业结构将向高级化演进，这将给生态产业园的产业选择和产业发展提供良好的机遇。
4、挑战
1）国际竞争加剧
生态型经济是发达国家的战略重点和国际竞争的制高点，也是各国争夺的焦点。东莞生态产业园在发展过程中，将面临十分激烈的竞争。总体上看，与发达国家和地区相比，东莞生态产业园在人才、资金、技术等方面还处于劣势，将面对发达国家和地区占优势地位的压力。
2）招商引资面临困难
随着世界经济进入调整，发达国家贸易保护主义抬头，给生态产业园招商引资带来困难。国内，中央和省加强了对大型项目布局落户的政策控制，地方主控权减少，也将影响到生态产业园的项目选择和引进。
3）区域竞争激烈
目前，全国各地纷纷涌现生态型产业园区，中新天津生态城、上海东滩生态产业园等发展势头迅猛。珠三角地区的产业竞争也给东莞生态产业园带来巨大压力，广州中新知识城，深圳的产业置换和惠州的产业争夺将给东莞生态产业园的产业和项目引进形成竞争。广东循环经济园遍地开花，佛山南海以循环经济为特色的生态产业园已经初具规模，这些将给东莞生态产业园的发展形成一定压力。
4）对发展环境提出更高要求
在产业和项目选择上，对生态环境适应性的硬约束不利于起步阶段生态产业园产业规模的快速壮大。因此，如何科学处理产业发展与生态修复、保护之间的关系是一个巨大的挑战。